阿里云智能达摩院-新冠肺炎全基因组测序智能分析

解决方案及特色

基因组检测需要做到快速准确，对海量测序数据做到快速分析需要强大的计算和存储系统。依托阿里云强大的云平台，支持线上和本地化大数据套件部署。
基因组数据分析方面，主要提供并行、分布式的大数据分析系统。功能包括序列质控、序列比对、序列拼接。每个步骤经过优化设计和参数调优使得对于 CPU 和内存的利用更为高效，从而有效减少了数据分析的时间。此外，系统提供友好界面，并支持一键出分析报告功能。
除了病原体检测之外，对于不同来源病原体的序列和结构分析有助于实现病原体的朔源和对应药物分析。进化分析以及基于深度学习的人工智能算法能够加速并且精准实现预期目的。
系统采用云架构，支持线上和用户本地部署。配合阿里云专有云的 Iaas 和 Paas 系统，快速搭建大数据平台。该平台采用分布式存储和分布式计算系统，有效解决基因测序数据量大，分析计算需要分布式或并行方式的特点。基于该大数据平台，分析速度能有效提升 4~10 倍，人工智能分析处理速度也大幅提升。

应用与效果

全基因组测序技术在全国进行应用实践。阿里达摩院在浙江省疾控中心和武汉金银潭医院做试点应用，效果不错，整体准确率非常高。